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如何選取指引物標(biāo)識(shí)牌(指引標(biāo)識(shí)圖片)

昊田標(biāo)識(shí)網(wǎng) 0 2024-01-28 08:05:27

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本文目錄一覽:

  • 1、模板,引物,底物這三個(gè)詞指的都是原料吧?糾結(jié)
  • 2、探針設(shè)計(jì)在線-如何實(shí)現(xiàn)原位雜交之探針設(shè)計(jì)
  • 3、3000bp的DNA如何分段設(shè)計(jì)引物
  • 4、Ta指引物與模板結(jié)合時(shí)候的溫度參數(shù)
  • 5、如何設(shè)計(jì)含attb位點(diǎn)的pcr引物

模板,引物,底物這三個(gè)詞指的都是原料吧?糾結(jié)

1、不可以這么說(shuō)。模板一般用在DNA復(fù)制、轉(zhuǎn)錄、翻譯過(guò)程中,指攜帶遺傳信息的 多核苷酸單鏈;引物指在基因工程中模板作用的一小段DNA單鏈;底物指在酶促反應(yīng)中的反應(yīng)物。這三個(gè)詞都要有特定的環(huán)境才能使用。

如何選取指引物標(biāo)識(shí)牌(指引標(biāo)識(shí)圖片)

2、引物是一小段單鏈DNA或RNA,作為DNA復(fù)制的起始點(diǎn),底物就是參與反應(yīng)的物質(zhì),就像化學(xué)反應(yīng)中的反應(yīng)物。

3、PCR分為三個(gè)步驟:變性,退火和擴(kuò)增。在PCR的過(guò)程中,DNA序列中的兩端起始點(diǎn)是需要的,這兩個(gè)點(diǎn)被稱為引物。引物的作用是為酶提供開始復(fù)制的起點(diǎn)。PCR反應(yīng)的底物主要包括模板DNA、引物、酶和所需的緩沖液等。

4、如果你指的是PCR技術(shù)的話,反應(yīng)需要的物質(zhì):需要模板(要擴(kuò)增的DNA)、引物(RNA,前后引物)、底物(dNTP,即dATP,dTTP,dGTP,dCTP)、DNA聚合酶(耐熱,常用的是Taq酶)、合適的緩沖液。

5、反應(yīng)物指的是原料,轉(zhuǎn)錄是以DNA為模板,4種游離的核糖核苷酸為原料合成RNA的過(guò)程,此過(guò)程新生成的是RNA。

6、模板:轉(zhuǎn)錄具有不對(duì)稱性:在RNA的轉(zhuǎn)錄中,用作模板的DNA鏈稱為反義鏈。有義鏈(編碼鏈,正鏈)在RNA的轉(zhuǎn)錄中,不作為模板的DNA鏈稱為有義鏈。

探針設(shè)計(jì)在線-如何實(shí)現(xiàn)原位雜交之探針設(shè)計(jì)

原位雜交探針長(zhǎng)度是100-400nt。用于原位雜交的探針可以是單鏈或雙鏈DNA,也可以是RNA探針。通常探針操作的長(zhǎng)度以100-400nt為宜,過(guò)長(zhǎng)則雜交率減低。

在設(shè)計(jì)時(shí),可依據(jù)圖上三種指標(biāo)的信息選取序列,如果覺(jué)得合適,可點(diǎn)擊Tm圖塊上左下角的Upper按鈕,選好上游引物,此時(shí)該按鈕變成,表示上游引物已選取好。下游引物的選取步驟基本同上,只是按鈕變成Lower。

雜交后處理 雜交完,以后的步驟不必要特意防RNA酶。棄去雜交液,載片浸入2xSSC中2×15 min。載片浸入1xSSC中55℃水浴搖動(dòng)2×15 min。用含20mg/mL的RNaseA的NTE緩沖液37℃消化30分鐘,以去除未結(jié)合的探針。

你要檢測(cè)的片段你一定知道吧?讓試劑公司給你合成就行啦!要是當(dāng)做一個(gè)問(wèn)題回答的話就更簡(jiǎn)單啦!把你要檢測(cè)的片段用DnaseⅠ進(jìn)行部分酶切,然后在用帶有標(biāo)記的dNTP進(jìn)行DNA合成補(bǔ)齊缺口,這樣帶有標(biāo)記的探針就合成了。

原位雜交是應(yīng)用核酸探針與組織或細(xì)胞中的核酸按堿基配對(duì)原則進(jìn)行特異性結(jié)合形成雜交體,然后應(yīng)用組織化學(xué)或免疫化學(xué)方法在顯微鏡下進(jìn)行細(xì)胞內(nèi)定位或基因表達(dá)的檢測(cè)技術(shù)。

3000bp的DNA如何分段設(shè)計(jì)引物

真的要分段,在中間找個(gè)酶切位點(diǎn)分成兩段就好了,每段一千多,也就可以了。再多了實(shí)在沒(méi)意義,后面還麻煩。注意這個(gè)酶切位點(diǎn)必須是在這2800bp中只有一個(gè),而且在酶切位點(diǎn)前后設(shè)計(jì)引物比較容易。

引物長(zhǎng)度一般在15-30bp。引物長(zhǎng)度一般為15-30bp,常用的為18-27bp,但不應(yīng)大于38bp,因?yàn)檫^(guò)長(zhǎng)會(huì)導(dǎo)致其延伸溫度大于74℃,不適于Taq DNA聚合酶進(jìn)行反應(yīng)。引物GC含量一般為40%-60%。

引物的長(zhǎng)度一般為15-30bp,常用的是18-27bp,但不應(yīng)大于38,因?yàn)檫^(guò)長(zhǎng)會(huì)導(dǎo)致其延伸溫度大于74℃,不適于TaqDNA聚合酶進(jìn)行反應(yīng)。

Ta指引物與模板結(jié)合時(shí)候的溫度參數(shù)

1、-850度左右。退火溫度(AnnealingTemperature)為引物和模板結(jié)合時(shí)候的溫度參數(shù),當(dāng)50%的引物和互補(bǔ)序列表現(xiàn)為雙鏈DNA分子時(shí)的溫度·它是影響PCR特異性的較重要因素。

2、核酸加熱到一定溫度就會(huì)兩條鏈分開,讓總核酸中有一半的核酸兩條鏈都分開的溫度就是核酸的退火溫度。退火溫度是指引物和模板結(jié)合時(shí)候的溫度參數(shù),當(dāng)百分之50的引物和互補(bǔ)序列表現(xiàn)為雙鏈DNA分子時(shí)的溫度。

3、×(G+C)+2×(A+T)-(5~8)。不銹鋼退火溫度確定的計(jì)算公式是:4×(G+C)+2×(A+T)-(5~8)。退火溫度是指引物和模板結(jié)合時(shí)候的溫度參數(shù),當(dāng)50%的引物和互補(bǔ)序列表現(xiàn)為雙鏈DNA分子時(shí)的溫度。

如何設(shè)計(jì)含attb位點(diǎn)的pcr引物

1、PCR引物設(shè)計(jì)方法和原理pcr中引物的作用是作為DNA復(fù)制開始時(shí)DNA聚合酶的結(jié)合位點(diǎn),在細(xì)胞外的條件下,只有通過(guò)引物,DNA才可以開始進(jìn)行復(fù)制。

2、引物5撇端可以修飾。引物3撇端不可修飾。引物3撇端要避開密碼子的第3位。引物設(shè)計(jì)需要注意的地方很多,在大多數(shù)情況下,我們都是在知道已知模板序列時(shí)進(jìn)行PCR擴(kuò)增的。

3、引物3′端不可修飾: 引物的延伸是從3′端開始的,不能進(jìn)行任何修飾。3′端也不能有形成任何二級(jí)結(jié)構(gòu)可能,除在特殊的PCR(AS-PCR)反應(yīng)中,引物3′端不能發(fā)生錯(cuò)配。

4、引物最好在模板cDNA的保守區(qū)內(nèi)設(shè)計(jì)。引物長(zhǎng)度一般在15-30堿基之間。引物GC含量在40%-60%之間,Tm值最好接近72℃。引物3′端要避開密碼子的第3位。引物3′端不能選擇A,最好選擇T。

5、’端避免有3個(gè)堿基以上的互補(bǔ)序列。 序列特異性:引物設(shè)計(jì)完畢請(qǐng)使用 NCBI BLAST功能檢索引物特異性,以避免非特異性擴(kuò)增產(chǎn)生。注意: PCR的產(chǎn)量通常取決于PCR引物的3’端,引物間形成二聚體會(huì)降低擴(kuò)增效率。

6、pcr中引物的作用是作為DNA復(fù)制開始時(shí)DNA聚合酶的結(jié)合位點(diǎn),在細(xì)胞外的條件下,只有通過(guò)引物,DNA才可以開始進(jìn)行復(fù)制。

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